umowa o dzieło odprowadzenie podatku

Witam
Jestem zupelnym laikiem w dziedzinie prawa wiec zawitalem na to furum .
Mam kilka pytan odnosnie umowy o dzielo. Sprawa wyglada nastepujaco:
Jestem studentem i zobowiązałem sie do napisania programu komputerowego pewnej firmie. Podpisujemy umowe o dzielo i co dalej? Jak wyglada procedura odliczenia podatku? Od jakiej kwoty nalezy spisywac umowe czy cos w tym rodzaju? Czy o dzielo za 100 zl rowniez nalezy podpisywac umowe? Czytalem ze pozniej firma powinna przyslac mi PIT i ja na jego podstawie mam zlozyc zeznanie podatkowe...
Przepraszam jezeli zadaje pytania na poziomie podstawowki ale prawo to nie moja dziedzina
Dziekuje za odp
Pozdrawiam

Po wykonaniu dzieła należy wystawić rachunek za wykonaną pracę.
Za wykonanie zamówionego programu (uwzględniamy prawa autorskie):
brutto minus koszty uzyskania 50% = X
X pomnożone przez 19% daje nam podatek, który odlicza się od kwoty brutto.
Pozostaje do wypłaty kwota nett.
Natomiast gdy nie uwzględniamy praw autorskich, to koszty uzyskania = 20%.

Zamawiająca dzieło firma wystawia PIT-11 - do uwzględnienia w zeznaniu rocznym (PIT-37).

To ja mam podobne pytanie, tylko sobie sam skomplikowałem sytuacje przez niewiedzę (moją jak i zlecającego), zrobiłem mniej więcej to samo co kolega, ale umowa byla na 500zl i dosatłem to 500zł do ręki, co powiniennem teraz zrobić?

(Dodam jeszcze, że mam do tego umowę o pracę na czas określony w innym zakładzie)